Efecto de la Dieta en el Microbioma Intestinal de Organismos Acuáticos

El tracto digestivo de los organismos esta colonizado por microorganismos que cumplen con variadas e importantes funciones. Mucho se ha estudiado la microbiota del tracto digestivo en organismos terrestres, pero poco en organismos acuaticos. Gracias a los recientes metodos de secuenciacion masiva del ADN, se ha abierto una ventana para explorar la composicion taxonomica (microbiota) de los microorganismos no cultivables que existen en todos los ecosistemas, y el intestinal no es la excepcion. Ademas, tambien ha sido posible conocer los genes que estan presentes (microbioma) en esos sitios al secuenciar todo el ADN presente, lo que se conoce como metagenomica. Es ya conocido que la dieta es quiza el principal factor que puede alterar la composicion tanto de la microbiota como del microbioma en animales terrestres, pero es poco lo que se conoce en animales acuaticos. Los principales factores que determinan el microbioma en peces son el nivel trofico (dieta), el habitat y quiza su posicion filogenetica (Sullam et al., 2012). En el presente trabajo, se contemplaran solo los avances que se han realizado en el efecto de la dieta en la microbiota y el microbioma obtenidos por metodos de secuenciacion masiva, ya que estos estan menos sujetos a desviaciones causadas por el metodo usado, como pueden ser especialmente los causados por metodos de cultivo dependientes o incluso aquellos cultivos independientes pero de poca resolucion como la electroforesis en gel con gradientes desnaturalizantes (DGGE por sus siglas en ingles) o el analisis de conformacion de una sola hebra (SSCA). Es ya plenamente conocido que el tracto intestinal de practicamente todos los animales estudiados contiene una alta cantidad de microorganismos comensales y una elevada diversidad taxonomica de estos. El caso de los 571 Gomez-Gil, B. et al. 2017. Efecto de la Dieta en el Microbioma Intestinal de Organismos Acuaticos. En: Cruz-Suarez, L.E., Ricque-Marie, D., Tapia-Salazar, M., Nieto-Lopez, M.G., Villarreal-Cavazos, D. A., Gamboa-Delgado, J., Lopez Acuna, L.M. y Galaviz-Espinoza, M. (Eds), Investigacion y Desarrollo en Nutricion Acuicola Universidad Autonoma de Nuevo Leon, San Nicolas de los Garza, Nuevo Leon, Mexico, pp. 570-581. ISBN 978-607-27-0822-8. organismos acuaticos no es diferente y diversos estudios se han enfocado a caracterizar la microbiota o el microbioma del tracto intestinal de peces y, en menor medida, de crustaceos.