Algorithmique parallèle et calcul haute performance dédiés à la simulation d'un système hôte-macroparasite

Ce travail contribue a un modele deterministe discret d'un systeme hote-macroparasite et propose un modele stochastique equivalent. Une application du modele consiste en l'etude quantitative du systeme Bar-Diplectanum Aequans a l'aide de deux simulateurs paralleles. Une etude algorithmique detaillee est donnee pour le simulateur deterministe. L'extensibilite de tres bonne qualite est evaluee theoriquement et testee. Une utilisation optimisee des memoires caches permet d'atteindre 60 % de la puissance crete au coeur des calculs. Les temps d'execution sont reduits et la precision des calculs amelioree, ce qui permet de reproduire des dynamiques observees sur le terrain. Le second simulateur utilise une methode de type Monte Carlo. On donne les performances associees a une programmation hybride sur une grappe de noeuds SMP. L'etude quantitative effectuee sur les resultats des simulateurs donne un eclairage nouveau sur l'interaction des mecanismes des systemes hote-macroparasite.