ESTUDO DE CASO: INVESTIGANDO A ORIGEM E EPIDEMIOLOGIA DO ZIKA VÍRUS NO BRASIL ATRAVÉS DA BIOINFORMÁTICA.

2019 
O virus Zika, e um virus de RNA do genero flavivirus, descrito em 1947 presente em amostra de macaco de Uganda. Transmitido atraves da picada de mosquitos Aedes sp., alem das publicacoes de casos que mostram a transmissao por transfusao, contato sexual e de mae para filho. Relatos de infeccao por Zika em humanos eram limitados a pequenos surtos em paises da Africa, resultando na chamada febre Zika, cujos sintomas incluem erupcao maculopapular, cefaleia, conjuntivite e mialgia. Nas americas o pais que apresentou o maior numero de casos foi o Brasil alem de grande parte desses casos, estar associada a microcefalia. A confirmacao de que era o Zika virus foi dada em 2015 e devido a gravidade (numero de casos elevado alem do aumento nunca visto de microcefalia) toda atencao foi dada ao nosso pais. Comparado com os pequenos surtos anteriores em paises africanos, nosso caso e considerado o maior e mais grave. A grande questao apos a confirmacao de 2015 era: De onde veio o virus descrito inicialmente em Uganda? O objetivo deste trabalho e introduzir o ensino de Bioinformatica e Genomica atraves da revisao de literatura do estudo investigativo da epidemiologia do Zika virus no Brasil e nas Americas, realizando na pratica as mesmas comparacoes genomicas feitas pelos grupos de pesquisa. Iniciamos com a revisao das publicacoes para obter informacoes sobre as sequencias geradas e depositadas em bancos de dados. Entendemos o processo de extracao, transcricao reversa e sequenciamento do genoma viral. Na pratica, usando computadores conectados a internet e com programas de bioinformatica instalados, obtivemos do maior banco de dados de informacao biotecnologica do mundo (GenBank) as sequencias genomicas virais obtidas aqui no Brasil. Os genomas selecionados no GenBank foram submetidos ao alinhamento multiplo no software MEGA e os trechos conservados anotados, bem como, os que apresentavam variacoes. Foram isolados e identificados os trechos com variacoes para conhecimento de sua funcao biologica no software GeneRunner seguido de BLASTx. Por comparacao de genomas via algoritmo BLAST, realizamos uma investigacao que alem de mostrar quais os virus mais similares ao nosso, refazendo assim o caminho de entrada do Zika no Brasil, apontaram que nossa cepa veio da China. Ao final, produzimos um mapa indicando o caminho do Zika nas Americas e Brasil, descrevendo os numeros de acesso de cada sequencia e as regioes nao conservadas, mostrando que o virus nao sofreu mudancas geneticas significativas. As alunas tiveram contato com bancos de dados reais, sequencias reais e realizaram a mesma comparacao dos grupos de pesquisa. Portanto, hoje, alem de entenderem o caso Zika virus no Brasil, elas tambem conhecem detalhadamente como se realiza uma investigacao por bioinformatica atraves da busca de similaridades geneticas empregadas em estudos de origem. Esse conhecimento sera empregado nos trabalhos do grupo de iniciacao cientifica que comecou este ano.
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