Perfil de expresión génica en el cáncer de próstata: identificación de marcadores candidatos para el diagnóstico no invasivo

Resumen Objetivo Analizar los perfiles de expresion genica del cancer de prostata (CaP) e identificar los genes diferencialmente expresados. Determinar si la expresion diferencial en tejido se mantiene en muestras de orina-posmasaje prostatico (PMP). Material y metodos Un total de 46 muestras de tejido prostatico (36 de pacientes con CaP y 10 controles) y 158 orinas-PMP (113 de pacientes con CaP y 45 controles) se recogieron entre diciembre de 2003 y mayo de 2007. Se utilizaron microarrays de ADN para identificar los genes diferencialmente expresados entre las muestras de tejido tumorales y las controles. Diez genes fueron seleccionados para la validacion tecnica de los microarrays en las mismas muestras tisulares mediante PCR cuantitativa (RT-qPCR). Se seleccionaron 42 genes para ser validados en muestras de orina-PMP mediante RT-qPCR. Resultados El grafico de escalado multidimensional mostro una clara separacion entre las muestras de tejido tumorales y las controles. Se han identificado 1.047 genes diferencialmente expresados (FDR ≤ 0,1) entre los 2 grupos. La correlacion entre los datos de microarrays y RT-qPCR fue alta (r = 0,928, p  HOXC6, PCA3 , PDK4 y TMPRSS2-ERG ) mostraron diferencias de expresion estadisticamente significativas entre orinas-PMP tumorales y controles (p  Conclusion Existe un perfil de expresion genica diferencial en el CaP. Aunque la extrapolacion de la expresion genica obtenida en tejido prostatico a orina-PMP se debe realizar con precaucion, el analisis del tejido prostatico permite la identificacion de nuevos biomarcadores para diagnostico no invasivo del CaP.