Archivierung von Genomdaten

Angesichts der zunehmenden Datenflut in der Genomforschung wird ein effizientes Forschungsdatenmanagement, verbunden mit einer sicheren und nachhaltigen Archivierung, auch in diesem Wissenschaftsbereich immer wichtiger. Der letzte von 3 Artikeln der Reihe „Forschungsdatenmanagement von Genomdaten“ beschreibt allgemein den Lebenszyklus von Forschungsdaten – ausgehend von deren Planung, uber die Auswahl und Ubernahme der Daten fur die Speicherung bis hin zu notwendigen Erhaltungsmasnahmen und dem Zugriff durch Datennutzer. Archive spielen in fast allen Phasen dieses Zyklus eine Rolle und bilden daher eine wichtige Komponente der Verarbeitung von Genomdaten. Beispielhaft werden 3 offentliche europaische Archive fur Genomdaten vorgestellt: die Datenbank des European Molecular Biology Laboratory (EMBL), das Sequence Read Archive und das Trace Archive. Da jede dieser Einrichtungen jedoch auf eine bestimmte Art von Daten spezialisiert ist, bleibt ein Bedarf an zusatzlichen Langzeitarchiven, die flexibel mit verschiedenen Datentypen umgehen bzw. auf zusatzliche Datentypen erweitert werden konnen. Fur solche Archive wird ein generisches Konzept beschrieben und mit Empfehlungen fur dessen praktische Umsetzung verbunden.