miR-29a和miR-142-3p促进髓系分化的基因调控网络

2014 
目的 深入了解miR-29a/miR-142-3p参与促进髓系分化的调控网络.方法 首先实现miR-29a和miR-142-3p在HL-60细胞中的过表达,同时使用PMA以及ATRA分别诱导HL-60细胞向单核及粒系分化.May-Grunwald-Giemsa染色方法观察核形态变化,Real-time PCR检测细胞内CD11和CD14的表达.mRNA表达谱芯片分析获得表达模式相似的基因,利用DAVID和GeneMANIA进行GO categories和信号通路归类分析.PicTar和TargetScan进行靶基因预测,双荧光报告基因实验确定靶基因的真实性.结果 miR-29a/miR-142-3p过表达细胞与PMA/ATRA诱导分化细胞在整体基因表达模式上有较高的相似度,而表达模式相似的基因大多与细胞分化相关,且在GO分析中显著富集.同时,ZBTB5、CaMKK2、SUV420H2、TRIB2和CANX被确定为miR-29a新的靶基因.结论 miR-29a/miR-142-3p通过调节其靶基因活性,引发整个基因表达调控网络的改变,使之趋向于髓系分化过程中的基因表达变化,从而促进髓系分化进程.
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