Secuenciación de ARN antiguo en bioarqueología : revisión

espanolLa secuenciacion de primera generacion (FGS; del ingles, “First-Generation Sequencing”) revoluciono la biologia molecular en general, y la bioarqueologia en particular. Ello permitio estudiar restos de ADN antiguo (ADNa) por primera vez. La secuenciacion de segunda generation (SGS; del ingles, “Second-Generation Sequencing”) mejoro aun mas el rendimiento, reduciendo el tiempo y coste por base nucleotidica secuenciada. Ademas, permitio secuenciar genomas antiguos completos, como los de neandertales. La secuenciacion de tercera generacion (TGS; del ingles, “Third-Generation Sequencing”) mejoro aun mas el rendimiento de SGS, permitiendo ademas secuenciar moleculas individuales, sin requerir pasos previos de amplificacion o modificacion. Ello es revolucionario, evitando posibles sesgos asociados a tales pasos previos. Esto abre la puerta para la secuenciacion directa verdadera del ARN [sin retrotranscripcion en ADN complementario (ADNc)], incluyendo ARN antiguo (ARNa). Diferentes plataformas de TGS estan surgiendo, prometiendo nuevos y emocionante descubrimientos en bioarqueologia, tanto para ADNa como ARNa francaisFirst-Generation Sequencing (FGS) revolutionized molecular biology in general, and bioarchaeology in particular. That allowed to study ancient DNA (aDNA) remains for the first time. Second-Generation Sequencing (SGS) further improved throughput, reducing time and cost per sequenced nucleotide base. Most importantly, it allowed to sequence full ancient-genomes, like the ones of Neanderthals. Third-Generation Sequencing (TGS) improved even more SGS throughput, also allowing to sequence single molecules, without requiring previous amplification or modification steps. That is revolutionary, overcoming putative biases associated to such steps. This opens the door for true-direct RNA sequencing [without retrotranscription into complementary DNA (cDNA)], including ancient RNA (aRNA). Different TGS platforms are arising, promising exciting new discoveries on bioarchaeology for both aDNA and aRNA