Genetic variability of type 3 echoviruses

Ce travail a pour but d’etudier la variabilite genetique et antigenique dans la region VP1 des echovirus de type 3 (E-3), serotype d’enterovirus incrimine dans des cas de meningites, d’atteintes neuromusculaires et de diabete de type 1 chez l’homme. Quarante-six sequences VP1 de souches E-3, dont 9 isolees chez des enfants tunisiens ont ete incluses. Analyses phylogenetiques et taux de divergence nucleotidique ont ete etudies sur la totalite de la VP1 et sur une portion de 290 nucleotides dans la partie 5’ de la VP1. Les sequences en acides amines ont ete deduites a la recherche de determinants antigeniques specifiques de genotypes. Les sequences E-3 se sont reparties en deux genogroupes, I et II ; la variabilite genetique globale au sein du serotype atteint 29,1 %. Le genogroupe I comporte des sequences assez heterogenes, certaines se regroupent en un genotype avec au plus 15,1 % de divergence. Les sequences du genogroupe II ont un maximum de divergence de 13,8 % et correspondraient a un seul genotype. Les deux genogroupes co-circulent et ont une distribution temporospatiale a large etendue. Des substitutions d’acides amines, pouvant etre specifiques de genogroupe, de genotype ou de variants particuliers, ont ete relevees. Ce travail est une premiere tentative de classification des E-3 en genogroupes et genotypes et rapporte de nouvelles sequences d’origine nord-africaine. Il contribue a une meilleure connaissance de l’epidemiologie moleculaire des enterovirus en general et des E-3 en particulier, serotype jusque-la tres peu etudie dans la litterature.