Construction of random sheared fosmid library from Chinese cabbage and its use for Brassica rapa genome sequencing project

作为定序 Brassica rapa 的工程的多民族的染色体的部分，连接组 R9 和 R3 被用绳子拖的平底渡船策略用一个细菌的人工的染色体(用绳子拖的平底渡船) 定序。当前的物理 contigs 被期望盖住两个染色体的约 90% euchromatins。作为工程进步，因为用绳子拖的平底渡船图书馆是限制，为顺序扩展的用绳子拖的平底渡船选择变得更有限酶特定。支持工程，一个随机的砍的 fosmid 图书馆被构造。图书馆与一般水准由 97536 克隆组成插入相应于七染色体等价物的约 40 kb 的尺寸，假定 550 Mb 的一种中国卷心菜染色体尺寸。图书馆被屏蔽，教材在用绳子拖的平底渡船克隆不能被选择扩大物理 contigs 的支架差距的九个点的序列的结束设计了。选择积极克隆是定序结束的检查在 fosmid 克隆和邻近的用绳子拖的平底渡船克隆之间的重叠。九 fosmid 克隆被选择并且充分定序。序列揭示了二完成的差距充满和七顺序延期，它能被用于证实 fosmid 图书馆将便于 B 的顺序结束的用绳子拖的平底渡船克隆的进一步的选择。rapa。