Conversion d’une base française de dossiers patients informatisés au modèle OMOP-CDM

Objectif Le modele de donnees commun observational medical outcomes partnership-common data model (OMOP-CDM) permet d’organiser et de standardiser les donnees patients (donnees administratives, dossiers medicaux electroniques, donnees hospitalieres…) provenant de differentes sources a travers le monde. OMOP-CDM a ete applique a de nombreuses sources de donnees, mais n’a jamais encore ete applique a des donnees francaises. Cette etude presente la conversion, l’evaluation et la validation de la base Disease Analyzer (DA) au modele OMOP-CDM. Methode La base de donnees DA (QuintilesIMS, EMR France) est une base de donnees medicales et de prescriptions de 1100 medecins generalistes liberaux en France. Les donnees de DA ont ete transposees dans les differents domaines de classification du modele OMOP-CDM V.5 a l’aide de tables de correspondance permettant de convertir le langage d’origine en langage commun. L’exactitude et l’integralite de l’information ont ete evaluees. La conversion a ete testee en repliquant une etude publiee sur les conditions de traitement des patients souffrant de fibrillation auriculaire (FA) realisee avec la base « Longitudinal patient database » (LPD, QuintilesIMS, EMR France). Les resultats obtenus avec DA et DA-OMOP ont ete compares entre eux et au regard de ceux obtenus avec la base LPD. Resultats Au total, 99,9 % des codes relatifs aux pathologies, resultats d’examens, procedures et dispositifs medicaux ont ete convertis, ainsi que 88 % des codes medicaments. Les codes manquant (12 %) concernaient des medicaments homeopathiques ou en vente libre. Dans DA-OMOP, l’âge moyen des patients AF etait de 74,4 ans, (versus 74,6 ans dans DA et 74,6 ans dans LPD), avec 58,4 % d’hommes (versus 58,4 % dans DA et 59,5 % dans LPD) et 81,3 % des patients avaient un score CHADs ≥ 1 (contre 81,6 % dans DA et 83,1 % dans LPD). En accord avec l’etude publiee, dans DA-OMOP, 51,9 % des patients AF a haut risque thromboembolique (45 % dans LPD) n’etaient, soit pas traites, soit traites sans respect des recommandations. Parallelement, 62,5 % des patients ayant un score CHADs = 0 (contre 66,4 % dans LPD) etaient « surtraites » par rapport aux recommandations. Conclusions La conversion de DA dans le modele OMOP-CDM est prometteuse. Elle permettra d’integrer les donnees francaises au large reseau international deja existant. Les prochaines etapes consisteront a affiner encore le mapping , a garantir la mise a jour continue de DA-OMOP et a preciser le champ d’application de cette base.