太行菊 NAC 转录因子基因 OpNAC1 的克隆及生物信息学分析

NAC 转录因子是植物中数量最大的转录因子，在植物的生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要 的作用。本研究以太行菊的叶片为研究材料，运用 RT-PCR 及 RACE 技术克隆得到一条太行菊的 NAC 基因完整的 cDNA 序列，命名为 OpNAC1 (GenBank 登录号 MF996370)，并对其进行了生物信息学分析。分析表明，OpNAC1 基因 cDNA 序列全长 1 208 bp，ORF 全长 855bp，编码 284 个氨基酸。预测其蛋白分子量32.68 kD，等电点 6.46，属于不稳定亲水性蛋白。不含有信号肽和跨膜结构，很可能定位于细胞核。OpNAC1 与菊花(ADQ20114.1)亲缘关系较近，同源性达 93.7%。二级结构预测表明，OpNAC1 蛋白由 40 个 琢- 螺旋(14.08%)、47 个 茁- 折叠(16.55%)和 197 个无规则卷曲(69.37%)组成，与三级结构预测基本相符。研究结果为今后深入研究 NAC 转录因子在太行菊中的生物功能提供基础。