IDENTIFICAÇÃO E ANÁLISE FILOGENÉTICA DE GENES PERTENCENTES À FAMÍLIA GÊNICA PLAC8 (PLACENTA ESPECÍFICA 8) EM EUCARIOTOS.

2017 
Inumeras pesquisas vem sendo realizadas a fim de buscar cultivares mais resistentes as condicoes de estresse em especies vegetais importantes para a alimentacao humana. Sabe-se que as mudancas bioquimicas e fisiologicas que ocorrem em plantas sob condicoes de estresse estao relacionadas com alteracoes na expressao genica. Um dos mecanismos envolvidos na resposta celular a condicoes de estresse e a morte celular programada.  Dentre as diversas familias genicas possivelmente relacionadas com a morte celular programada uma das menos estudadas e a familia PLAC8 (Placenta especifica 8). Buscando contribuir com o conhecimento do papel desta familia genica, o presente trabalho iniciou-se atraves da busca de genes PLAC8 relacionados a regulacao da morte celular programada em eucariotos. Para tanto, sequencias proteicas dos genes PLAC8 de Arabidopsis thaliana ( At1g52200 e At4g23470), foram utilizados como iscas para buscas nos bancos de dados Phytozome ( http://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html ), PLAZA ( http://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/ ), metazome ( https://metazome.jgi.doe.gov/pz/portal.html ) e fungi ( http://fungi.ensembl.org/index.html ). A presenca de dominios conservados nas sequencias PLAC8 putativas identificadas foram verificadas usando o software MEME (http://meme.sdsc.edu/meme/). Para analisar a existencia do dominio transmembrana, o software TMHMM ( http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ ) foi utilizado. Analises filogeneticas foram realizadas utilizando o software Beast ( http://beast.bio.ed.ac.uk/ ). A analise da expressao dos genes identificados em diferentes orgaos e condicoes de estresse em plantas foi realizada atraves do software GENEVESTIGATOR ( https://genevestigator.com/gv/ ) e BAR ( http: //bar.utoronto.ca/welcome.htm ). Foram identificados ao todo 337 genes pertencentes a familia PLAC 8 em eucariotos. No presente estudo, propusemos a unificacao da nomenclatura para os genes contendo o dominio PLAC8. Os resultados demonstraram que a familia PLAC8 pode ser dividida em tres grupos:  I, II e III. Enquanto os genes PLAC8 do tipo I sao amplamente distribuidos em plantas, algas e fungos, os do tipo II e III sao exclusivamente encontrados de plantas. Os genes PLAC8 tipo III foram descritos pela primeira vez nesse trabalho. Os genes PLAC8 apresentaram forte modulacao em sua expressao sob condicoes de estresse biotico e abiotico. Os genes identificados nesse trabalho apresentam potencial de utilizacao em programas de melhoramento genetico vegetal e vem sendo caracterizados funcionalmente em projetos que encontram-se atualmente em andamento.
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