Exploitation des données de vie réelle issues d’un registre en oncologie : comment identifier les lignes de chimiothérapie d’une cohorte de patientes atteintes d’un cancer ovarien

2020 
Introduction La ligne de therapie est utilisee pour decrire les regimes de chimiotherapie qu’un patient recoit pour traiter son cancer. Un changement de ligne de therapie est generalement initie lorsque le traitement ne parvient plus a controler la maladie, qu’il n’est plus tolere par le patient ou lorsque le patient est en rechute. Ces changements de lignes de traitement ne sont pas collectes de facon uniforme, facilement identifiables et extractibles dans les bases de donnees de vie reelle retrospectives comme les registres. Par ailleurs, la gestion des patients atteints de cancer est souvent complexe, individualisee par patient, et un traitement peut etre modifie pour ameliorer la tolerance, meme lorsque celui-ci est efficace. Objectif L’objectif de ce travail est de presenter la methode mise en œuvre et les algorithmes developpes pour identifier les lignes de traitements de patientes atteints de cancer ovarien a partir d’une base de donnees composee de donnees medico-administratives. Materiel et methode La plateforme utilisee a pour objectif de decrire au cours du temps l’evolution de la prise en charge des patients et des strategies therapeutiques, dans une approche medico-economique a grande echelle. Cette base de donnees dans les cancers de l’ovaire est alimentee depuis 2012 a partir de trois sources d’information : – la base “patient”, centralisant les donnees disponibles dans les dossiers patient informatises (DPI) ; – la base “traitement”, centralisant les donnees relatives aux dispensations realisees par la pharmacie ; – la base “sejour”, centralisant les donnees decrivant les sejours hospitaliers. Les donnees des patientes issues de ce registre ont ete utilisees dans le cadre d’etudes visant a decrire les caracteristiques cliniques et le mode de traitement. En particulier une etude a ete realisee chez des femmes presentant un cancer de l’ovaire epitheliale sereux ou endometrioide de haut grade avance de novo. Ces resultats observes en vie reelle ont permis de conforter les resultats obtenus dans essais cliniques recents Le developpement d’un algorithme de tri des traitements anti-cancereux par ligne au cours du temps a necessite plusieurs etapes : – prise en compte des avis d’experts pour definir les differentes bornes a prendre en compte pour les dates de chirurgie et les dates des traitements afin de bien qualifier les populations de l’etude ; – modelisation par les data managers et statisticiens des lignes types attendues en prenant en compte les informations relatives aux progressions, aux chirurgie et aux dates de debut et fin des differents traitements (chimiotherapie et therapie ciblees) et en se basant sur des informations issues des differents guidelines de prise en charges du cancer de l’ovaire applicables a la date de traitement des patientes incluses (prise en compte d’un effet de temporalite lie a l’evolution des pratiques sur la periode definie) ; – programmation de l’algorithme, revue des incoherences et ajustement selon les avis des experts medicaux ; – analyse d’impact suite aux modifications apportees notamment sur les tailles des populations d’analyses ; – implementation des modifications dans la programmation puis revalidation des cas pouvant poser probleme. Resultats Partant des donnees de 8021 femmes souffrant d’un cancer ovarien presentes dans le registre, un sous-groupe de 267 patientes correspondant a la population cible de l’etude a pu etre identifie, selectionne et analyse. Ce sous-groupe correspondait aux femmes adultes au moment du diagnostic primaire de cancer de l’ovaire, avec un cancer de l’ovaire epitheliale sereux ou endometrioide de haut grade avance de novo (FIGO III-IV), ayant recu une chimiotherapie de premiere ligne a base de platine entre le 01/01/2011 et le 31/12/2016, sans aucune rechute dans les huit semaines ayant suivi la fin de cette chimiotherapie et avec une mutation nocive de la BRCA. Il a pu etre mis en evidence que sur ces 267 femmes, 36 % avaient eu une seule ligne de traitement, 27 % avaient eu deux lignes de traitement, 16 % trois lignes de traitement et 21 % quatre lignes ou plus de quatre lignes. Conclusion Le developpement de l’algorithme d’identification et de tri des lignes de traitement a permis la production d’une population homogene consolidee sur un large echantillon de donnees qu’il aurait ete impossible de produire facilement par une methode non automatisee. Plus que l’algorithme en lui-meme, l’interet de la methodologie developpee repose sur la definition d’une approche systematique prenant en compte la temporalite des recommandations de traitement issues des guidelines et l’enrichissement de l’algorithme par les avis d’experts pour reduire le nombre d’incoherences a chaque analyse.
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