ER~+和ER~-乳腺肿瘤细胞中mRNA和非编码RNA的表达模式

利用microarray分别获得MCF-7（雌激素受体阳性，ER + ）和MDA-MB-231（雌激素受体阴性，ER - ）两种乳腺肿瘤细胞的miRNA，lncRNA和mRNA表达谱.筛选差异表达的miRNA，预测其靶基因;对lncRNA和mRNA芯片数据进行生物信息学分析，对差异基因进行geneontology（GO）和pathway（信号通路）分析.对差异表达的mRNA和miRNA的靶基因作交集，再与差异表达的lncRNA建立共表达关系，在mRNA-lncRNA共表达网络中导入miRNA-mRNA相互作用，借此获得关键miRNA-mRNA-lncRNA相互作用.结果发现雌激素受体表型不同的乳腺肿瘤细胞中mRNA和非编码RNA的表达有显著性差异.在差异表达的miRNA中， miR-19a-3p，miR-19b-3p 等在MCF-7细胞中表达明显下调， miR-148b-3p 等在MCF-7细胞中表达显著上调.差异表达miRNA的靶基因分析结果显示， miR-19a-3p 和 miR-19b-3p 的靶基因为 ESR1 ;在差异表达的lncRNA中， uc001vet.1 （ DLEU1 ，Fc=15.44）， uc001ver.2 （ DLEU1 ，Fc=4.13）在MCF-7细胞中的表达明显增高.共表达分析表明， ESR1 与 uc001vet.1 和 uc001ver.2 具有较高的共表达系数，而且 miR-19a 和 miR-19b 与 DLEU1 均在13号染色体上.推断 miR-19a 和 miR-19b 可能与 DLEU1 共同作用影响ESR1的表达.由此推断miRNA-mRNA-lncRNA相互作用影响不同雌激素表型乳腺癌肿瘤细胞的发生发展，雌激素受体可能受miRNA和lncRNA的共同调控作用.