Estudo dos segmentos de homozigose em uma população de suínos.

Resumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotideo unico) sao uteis em estudos de estrutura da populacao e conservacao genetica, permitindo obter informacoes sobre a historia de uma populacao e parentesco entre seus individuos. Para investigar o historico de selecao de uma linhagem comercial materna de suinos, 300 femeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a deteccao de segmentos de homozigose (ROH, do ingles Runs of Homozygosity) com alta frequencia populacional. As regioes de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possiveis regioes conservadas. Um grande numero de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na populacao estudada. Nas regioes de homozigose com frequencia maior que 30% foram identificados 240 genes, dos quais alguns estao descritos como envolvidos na expressao de caracteristicas reprodutivas e de comportamento. Logo, o presente estudo reforca a eficacia na utilizacao de dados de ROH para o estudo do historico de selecao em populacoes animais, e sugere que os ancestrais da populacao estudada possivelmente foram submetidos a selecao direta ou indireta para caracteristicas reprodutivas e comportamentais. Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) markers are useful to study population structure and conservation genetics, which allows assessing information about population history and the relationship among individuals. To investigate the population history, 300 females and 25 males from a commercial maternal pig line were analyzed using genomic data to detect runs of homozygosity (ROH). The ROH regions present in more than 30% of the samples were investigated to identify possible conserved regions. A large number of long ROHs (> 5Mb) were found and might indicate recent inbreeding events in the studied population. In the homozygous regions with frequency greater than 30% 240 genes were identified, which some of them were described affecting behavioral and reproductive traits. Therefore, the study showed evidence that the ancestors of the studied population have undergone direct or indirect selectionfor behavior and reproduction traits.