Apport de la qPCR au dépistage des infections des ruminants par des Anaplasmataceae : étude de cas au Pays Basque et en Corse

Les Anaplasmataceae sont des bacteries intracellulaires transmises aux animaux et a l’homme, principalement par les tiques. Les Anaplasma spp. (A. marginale, A. phagocytophilum…) et les Ehrlichia spp. (E. canis, E. ruminantium...) en sont les principaux representants d’importance economique et sanitaire. Les outils de diagnostic disponibles jouent un role determinant dans leur identification. Nous proposons une approche globale par un systeme permettant d’identifier la plupart des especes d’Anaplasmataceae. Il est base sur le gene codant l’ARNr 23S ; il couple une qPCR et une PCR standard avec deux jeux d’amorces suivie d’un sequencage. Il est teste pour en verifier la specificite, puis mis en oeuvre a partir de prelevements de sang de ruminants et de tiques : dans les Pyrenees-Atlantiques, des brebis suspectes d’infection sont porteuses d’A. ovis et leurs tiques Rhipicephalus bursa, d’A. ovis, d’A. phagocytophilum et d’une nouvelle ehrlichia. En Haute-Corse, une forte prevalence d’infections par les Anaplasmataceae est detectee dans des elevages (bovins, ovins, caprins) ou la symptomatologie retrocede lors de traitements a l’oxytetracycline. La specificite et la sensibilite du systeme de diagnostic utilise et sa capacite a identifier de nouvelles especes offrent des perspectives pour l’etude de l’epidemiologie des Anaplasmataceae et permettront de mettre en evidence de nouveaux reservoirs.