肠道病毒71型福建分离株（FJ08089）全基因组序列分析

[目的]分析2008年福建省手足口病患儿标本肠道病毒71型（EV71）分离株FJ08089全基因组序列特征。[方法]应用RD细胞,从患者疱疹液标本分离EV71,用RT-PCR方法扩增分离株病毒的全基因组,分析其基因组特征。[结果]FJ08089株的基因组长度为7 404 bp,其中包括5′端非编码区（5′UTR）长743 bp,病毒基因组编码区（ORF）全长6 576个核苷酸及3′端非编码区（3′UTR）长81 bp。ORF编码含2 192个氨基酸残基的多聚蛋白。[结论]FJ08089株基因组的结构与安徽地方株ANHUI703814十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为93.8%,氨基酸同源性为92.6%,均属于C4亚型,而与Cox.A16国际标准株G10（U05876）差别较大,两者核苷酸同源性仅为77.9%,氨基酸同源性为84.0%。