Intra- and interspecific divergence in the nuclear sequences of the clock gene period in species of the Drosophila buzzatii cluster

We have measured nucleotide variation in the CLOCK/CYCLE heterodimer inhibition domain (CCID) of the clock X-linked gene period in seven species belonging to the Drosophila buzzatii cluster, namely D. buzzatii, Drosophila koepferae, Drosophila antonietae, Drosophila serido, Drosophila gouveai, Drosophila seriema and Drosophila borborema. We detected that the purifying selection is the main force driving the sequence evolution in period, in agreement with the important role of CCID in clock machinery. Our survey revealed that period provides valuable phylogenetic information that allowed to resolve phylogenetic relationships among D. gouveai, D. borborema and D. seriema, which composed a polytomic clade in preliminary studies. The analysis of patterns of intraspecific variation revealed two different lineages of period in D. koepferae, probably reflecting introgressive hybridization from D. buzzatii, in concordance with previous molecular data. Resumen En este trabajo hemos medido la variacion nucleotidica en el dominio CCID en el gen period, localizado en el cromosoma X, asociado a los ritmos circadianos, el enjambre de siete especies que conforman denominado “cluster”Drosophila buzzatii: D. buzzatii, D. koepferae, D. antonietae, D. serido, D. gouveai, D. seriema y D. borborema. Nuestro estudio mostro que la seleccion purificadora es la principal fuerza que gobierna la evolucion de period, en acuerdo con una region que como CCID juega un papel importante en la maquinaria de los ritmos circadianos. Hemos observado que la variacion en period provee informacion filogenetica que permitio resolver la politomia que involucra a D. gouveai, D. borborema y D. seriema. Finalmente, el analisis de la variacion intraespecifica revelo la presencia de dos linajes en D. koepferae, uno de los cuales podria ser consecuencia de hibridacion introgressiva desde D. buzzatii, en acuerdo con estudios anteriores en regiones genicas localizadas en otros cromosomas.