Development of taxonomic rRNA-targeted probes of two harmful algae: Prorocentrum minimum and Karenia mikimotoi by fluorescence in situ hybridization

2013 
有害海藻的花蕾最近在在全世界的聚光灯下面,因为他们海洋的环境,水产业,渔业以及公共健康上的否定影响。为原因的种类的快速、精确的鉴定和 quantification 的方法的发展为花蕾,技术基于分类探针在之中是赞成的 themost 的警告 andmonitoring 是必要的。在这研究,二有害水藻,即,最小的 Prorocentrum 和 Karenia mikimotoi 被考虑。两个的部分大子单元 rDNA (D1-D2 ) 种类是第一放大 PCR 的,克隆并且定序。获得的序列然后被介绍为基因执行排列分析特定的区域。为每种的三根各自的候选人探针被设计并且过去常由在杂交(鱼) 测试的 situ 执行荧光屏蔽最佳的探查。结果证明探针 Pmin0443 和 Kmik0602 为 P 显示了最好的杂交。最小和 K。mikimotoi 分别地。两特定(分类)(Pmin0443 和 Kmik0602 ) 并且控制探针(UniC0512 和 UniR0499 ) 在我们的实验室与另外的 microalgae 被用于跨反应的测试。探针 Pmin0443 和 Kmik0602 是特定的并且能作为介绍进指向 rRNA 的技术的分类探针被服务,例如 P 的鱼,三明治杂交,和 DNA-microarray 试金。最小和 K。mikimotoi 以后。最后,有两探查的鱼分析在模仿的地样品上被执行。探针能专门有目标房间井的 hybridize,和没有重要差别(p > 0.05 ) 在鱼和轻显微镜学(LM ) 决定的样品的房间密度被观察。都建议探针是特定的并且能为监视两有害水藻被介绍进鱼。
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