Mise en évidence de gènes cibles directs communs à FLI-1 et à SPI-1/PU.1 dans les érythroleucémies de Friend

2010 
Les facteurs de transcription FLI-1 et SPI-1/PU.1 appartiennent a la famille ETS et reconnaissent le meme motif sur l’ADN GGAA. Leur activation est observee de maniere recurrente dans les erythroleucemies murines induites par le virus de Friend. Ces observations suggerent un role crucial de ces deux facteurs dans la transformation de la lignee erythrocytaire potentiellement par la deregulation de genes cibles communs. Mon travail de these a consiste a tester la contribution de ces deux facteurs au phenotype des cellules erythroleucemiques et a rechercher les genes cibles directs communs.Nous avons pu montrer que FLI-1 et SPI-1/PU.1 ont des contributions additives au phenotype des cellules erythroleucemiques surexprimant les deux facteurs. Par une approche transcriptomique, nous avons identifie une grande proportion de genes cibles directs communs a FLI-1 et a SPI-1/PU.1 impliques dans differentes etapes de la biogenese des ribosomes. La depletion de ces facteurs induit une reduction de la biogenese des ribosomes qui n’induit pas de stress ribosomique stabilisant p53. Neanmoins, nous avons mis en evidence une contribution specifique de RPL11, un mediateur essentiel du stress ribosomique, a la differenciation des cellules erythroleucemiques induites par l’absence de ces facteurs.Nous avons mene en parallele l’inventaire par ChIP-Seq des sites de recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur le genome entier de 3 lignees erythroleucemiques independantes. Cette strategie nous a permis de montrer que les regions de recrutement communes sont la consequence de la proximite de consensus specifiques et distincts et du recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur leur propre consensus.
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