ОПТИМИЗАЦИЯ УСЛОВИЙ МНОЖЕСТВЕННОЙ ПЦР ДЛЯ РОДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ АКТИНОБАКТЕРИЙ Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, Оренбург, Россия Цель. Оптимизация тест-системы идентификации бактерий родов Bifidobacterium и Pronionibacterium c помощью системы двухфазной множественной ПЦР.

из коллекции лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований ИКВС УрО РАН матричная ДНК подвергалась тесту на родовую принадлежность методом множественной ПЦР с помощью праймеров, разработанных на основе вариабельности гена 16S РНК с помощью ДНК-амплификатора «Терцик МС2» (НПФ «ДНК-Технология»). Отладка алгоритма амплификации проводи-лась в управляющей программе «TherCyc 2.1». Детекция ампликонов производилось ме-тодом агарозного гель-электрофореза. Результаты. Проведенная оптимизация алгоритма ПЦР путем повышения темпе-ратуры отжига до 72°C и сокращения всех фаз процесса позволило уменьшить общее вре-мя протекания реакции с 60 до 40 минут. Заключение. Оптимизация алгоритма амплификации применительно к возможно-стям конкретного оборудования и праймеров позволяет добиться сокращения времени амплификации на 1/3. Ключевые слова: множественная ПЦР, облигатные анаэробы, актинобактерии, би-фидобактерии, пропионибактерии