ПОСТРОЕНИЕ МОДЕЛЕЙ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКОВ ПО ДАННЫМ ТРИТИЕВОЙ ПЛАНИГРАФИИ

Представлены результаты моделирования пространственной структуры белков с помощью метода тритиевой планиграфии. Знание трехмерной структуры макромолекул чрезвычайно необходимо для понимания основных механизмов взаимодействия в биологических системах и сложных технологических процессах. Известные ограничения методов рентгеноструктурного анализа (кристаллическое состояние) и ЯМР (молекулярные массы) делают необходимым поиск новых подходов к моделированию пространственных структур белков. Полуэмпирический метод тритиевой планиграфии является одним из таких подходов. Метод основан на бомбардировке исследуемого объекта пучком горячих атомов трития (Е атомов ≥ 0, 3 эВ) и компьютерной имитации эксперимента. На примере белков различных структурных классов показано, что с помощью такого комплексного подхода могут быть получены трехмерные модели структуры, достаточно хорошо согласующиеся с данными рентгеноструктурного анализа. При этом важным фактором является последовательность поиска контактов между элементами вторичной структуры: наилучшее совпадение модели с нативной структурой достигается при векторной сборке элементов в последовательности от N- к C-концу полипептидной цепи.