波纹唇鱼mtDNA D-loop序列变异分析

为研究波纹唇鱼（Cheilinusundulatus）线粒体D—loop序列遗传多样性，作者采用聚合酶链式反应和克隆技术对海波纹唇鱼群体（n=25）的mtDNA D-loop序列进行克隆和测序，获得长度大约为1400bp的产物。用ClustalX软件进行排序比较，将结果导入MEGA5．0，结果显示出在这25尾个体中，共检测出66个变异位点，包括0个碱基缺失，4个碱基插入，59转换位点，2颠换位点及1个转换和颠换同时存在的位点。并用MEGA5．0软件构建该群25尾个体的NJ和UPGMA系统树。由DNASP软件计算出该波纹唇鱼群体的多态位点数（印为62，核苷酸多样性（只）为0．00606，平均核苷酸差异数为6．907。结果表明波纹唇鱼群体的mtDNA—loop基因个体差异程度不明显。