Estudo De Sequências Promotoras De Hiv E Proteinas De Membrana Das Suas CÉlulas Alvo

Introducao: A Sindrome da Imunodeficiencia Adquirida e uma doenca que afeta uma parcela significativa da populacao mundial, sendo caracterizada pelo enfraquecimento do sistema imunologico. Causada pelo virus HIV, a AIDS pode ser transmitida atraves do sangue, leite materno, esperma, secrecao vaginal, e liquido seminal. O virus HIV faz parte dos retrovirus e possuem a capacidade de integrar sua informacao genetica no DNA das celulas infectadas. Entre as celulas alvo encontram-se os linfocitos T citotoxicos e monocitos, os quais sao reconhecidos pela interacao entre proteinas virais com as proteina de membrana CD4 e os co-receptores CCR5 ou CXCR4. Embora muito se conheca acerca do HIV, a pergunta sobre qual e a causa evolutiva do sucesso do HIV na escolha de linfocitos ou monocitos CD4 ainda esta em aberto e neste trabalho temos por objetivo gerar dados para contribuir na sua resposta. Material e Metodos: Para comparar a regulacao genica do virus HIV e proteinas presentes nos linfocitos T citotoxicos nos criamos uma tabela que apresenta a ausencia ou presenca de fatores de transcricao nas regioes promotoras de genes que codificam proteinas de membrana nesta linhagem celular. Assim, construimos uma base de dados das proteinas de membrana presentes em linfocitos T contendo os fatores de transcricao que se ligam nos promotores dos genes que as codificam. A regiao da sequencias promotoras foi ajustada entre -500 e +500 bases em relacao ao inicio da transcricao de cada gene e analisadas com a ferramenta de bioinformatica TESS usando a matriz de peso posicional TRANSFAC, com o filtro “human”. Esta ferramenta oferece um arquivo com extensao xls que facilita o estudo dos dados. Finalmente, os dados oferecidos por TESS foram avaliados com macros de Excel desenvolvidos pelo nosso grupo de pesquisa. Resultados e Discussao: No presente trabalho conseguimos ampliar a base de dados do nosso grupo para 203 sequencias analisadas de proteinas de membrana presentes em linfocitos T contra um total de 1085 fatores de transcricao. Desta forma criamos uma base de dados que relaciona as proteinas e os fatores de transcricao. Apos analise foi montada uma matriz contendo 244.800 dados que mostram que as sequencias dos 203 promotores analisados possuem em media 24 fatores de transcricao com desvio padrao de 4. Dos 1085 fatores de transcricao estudados unicamente 71 estao presentes nos promotores estudados sendo que 21 destes (30%) estao presentes em mais do que 60% das sequencias promotoras. Na comparacao entre os promotores do HIV e seus co-receptores a maioria dos fatores compartilhados sao aqueles presentes dentro do grupo do 30% acima citado. Entretanto, o fator NF-kB encontra-se presente em unicamente 19 dos 204 promotores estudados (9%) podendo ser um dos principais fatores a ser estudado no futuro deste trabalho. Conclusoes: Os dados obtidos ate agora mostram um panorama complexo na rede de regulacao genica entre o HIV e as proteinas celulares usadas por estes durante o processo de infeccao. Portanto, uma analise mais detalhada envolvendo outras proteinas sera necessaria, pois varios fatores de transcricao apresentaram potencial para estarem envolvidos durante a infeccao viral. A revisao bibliografica tambem mostra alguns fatores que estao relacionados a ativacao do virus na celula porem, os mesmo nao se apresentaram nos nossos dados. Assim, a regiao promotora sera obtida, alternativamente, com valores diferentes de -500 e +500, podendo estende-la para valores entre -1000 e +1000 ou, inclusive, -2000 e +2000. Orgao de Fomento: