Analyse de l'écologie microbienne par un outil moléculaire global: PCR-DGGE. Application aux poissons d'aquaculture du Vietnam : O1

La determination de l'origine geographique est une exigence du systeme de tracabilite de l'import-export des produits alimentaires. Une hypothese d'outil de tracabilite consiste a relier l'origine du produit alimentaire aux communautes microbiennes presentes sur le produit apres leur exportation. Pour ce faire, les techniques moleculaires employant les profils des ADNr 16S generes par PCR-DGGE ont ete utilises pour detecter les variations dans les structures communautaires bacteriennes des poissons Pangasius de la province d'An Giang au Sud Vietnam, recoltes dans differentes fermes aquacoles et pendant deux saisons differentes, la saison des pluies et la saison seche. Lorsque les profils d'ADNr 16S ont ete analyses par analyse multi variee, des communautes microbiennes distinctes ont ete detectees. Les profils des bandes des bacteries de poissons provenant de differentes exploitations sont differents et sont specifiques de chaque lieu. Ils pourraient donc etre utilises comme un code-barre pour certifier l'origine des poissons. Lorsque les profils de bande du meme lieu de prelevement, a differentes saisons ont ete compares, nous avons egalement observe que le spectre des bandes etait le meme pour chaque saison et discriminait les fermes. Certaines bandes communes ont ete relevees stables tout au long de l'annee quel que soit la saison. Ces bandes peuvent etre utilisees comme marqueurs specifiques pour ce lieu precis. Cette methode est un nouvel outil de tracabilite qui fournit aux produits de la peche un code a barres unique et permet de tracer le poisson vers leur lieu de production d'origine. (Resume d'auteur)