ANÁLISE COMPARATIVA DOS ELEMENTOS TRANSPONÍVEIS PRESENTES NO GENOMA DE DUAS VESPAS PARASITOIDES

2016 
A maioria dos genomas ja estudados ate o momento possuem sequencias que tem a capacidade de moverem-se de um local para outro. Essas sequencias sao conhecidas como elementos geneticos moveis, dentre eles estao os elementos transponiveis (ETs), que representam proporcoes consideraveis dentro dos genomas. Existe uma diversidade de ETs, desde de elementos simples que apenas codificam a enzima para a sua mobilizacao, assim como elementos mais complexos com diversas caracteristicas. Esses elementos sao classificados em dois tipos: os elementos de Tipo 1 que representam os ETs que mobilizam-se utilizando intermediarios de DNA, e os de Tipo 2 os que utilizam intermediarios de RNA, podendo possuirem ou nao longas repeticoes terminais (LTR) nas extremidades. Os ETs podem ainda serem classificados em classes, superfamilias e familias. O estudo da presenca desses ETs e de extrema importância para que se entenda melhor o seu papel dentro dos genomas, devido a presenca na maioria dos genomas e a capacidade de alterarem a estrutura genica de diversas maneiras. Diante disso, o seguinte trabalho teve como objetivo realizar uma analise comparativa dos ETs presentes nos genomas das vespas parasitoides, Leptopilina boulardi e outra vespa pertencente a familia Braconidae. Apos obter as leituras provenientes do sequenciamento do genoma das vespas, procedeu-se analises utilizando o webserver Repeatexplorer, para realizar uma separacao das sequencias inicias em clusters, representando as superfamilias de ETs presentes nos genomas. Utilizando-se o numero de leituras que compunham os clusters e utilizando como base o numero total de leituras estimou-se a porcentagem de cada grupo de ETs presentes nos dois genomas. Apos realizar as analises pode-se observar a presenca dos dois tipos de ETs nos genomas estudados, onde os elementos de tipo 1 foram mais abundantes na vespa da familia Braconidae em relacao a L.boulardi, apresentando 3,754% e 2,823% do genoma respectivamente. Dentro dos ETs de tipo 2, os elementos sem LTR foram mais presentes tambem na vespa da familia Braconidae em relacao a L.boulardi, apresentando 0,446% contra 0,376%. Ja os ETs com LTR foram mais abundantes em L.boulardi em relacao a Braconidae sendo de 1,994% e 1,647% respectivamente. Os genomas apresentaram um total de ETs de 5,847% para a vespa da familia Braconidae e 5,193% para L.boulardi. Diversas superfamilias foram encontradas nos genomas, porem algumas foram encontradas apenas no genoma de uma ou em outra vespa. Os elementos mais abundantes na vespa da familia Braconidae foram os Maverick-Polintons com 2,239% e os menos abundantes os hAT com 0,01%. Ja em L.boulardi os mais abundantes foram os Gypsy com 1,921% e os menos abundantes os Transib com 0,016% do genoma. Atraves desses resultados pode-se concluir de modo geral que o genoma da vespa da familia Braconidae apresenta uma porcentagem maior de elementos do tipo 1 , elementos do tipo 2 sem LTR e numero total de ETs do que a vespa L.boulardi, no entanto esse padrao e invertido em relacao aos ETs de tipo 2 com LTR.
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