Acquisition de données complémentaires aux dénombrements, avec les techniques de cytométrie en flux, fluorescence totale ou spectrale. Etat d’avancement et premiers résultats. Action Indice Composition. Livrable n° A III. Rapport final, 23 septembre 2014

L'element de qualite phytoplancton doit etre evalue dans le cadre de la Directive Cadre sur L’Eau grâce a trois indices : biomasse, abondance et composition. Les deux premiers indices, biomasse et abondance, ont deja ete definis. L’indice composition a quant a lui fait l'objet d'une proposition precise en Mediterranee, mais pas en Manche - Atlantique. Les travaux anterieurs montrent que la construction d'un indice de composition doit tenir compte de la diversite de l'ensemble du phytoplancton. Or, les comptages microscopiques ne concernent en general que le micro-phytoplancton. Il est donc necessaire de prendre en compte des informations supplementaires qui tiennent compte du nano- et du picophytoplancton, dont l'importance dans la diversite du phytoplancton est cruciale. Afin d'apprehender la diversite du phytoplancton dans toutes ses composantes, il est donc propose de ne pas se limiter au microphytoplancton, mais de considerer egalement les autres composants du phytoplancton, tels que le nano- et le pico-phytoplancton. Ceux-ci peuvent etre mesures par differentes techniques, qui sont complementaires : cytometrie en flux traditionnelle ou cytometrie en flux permettant d’enregistrer le profil optique de chaque particule, analyse des pigments par HPLC, fluorescence spectrale, FlowCAM / PhytoImage, biodiversite genetique. Par ailleurs, pour prendre en compte la dynamique du compartiment phytoplanctonique dans l’ensemble des eaux marines (en vue de definir les indicateurs pour la Directive Cadre Strategie Milieu Marin (DCSMM), des mesures a haute resolution deviennent indispensables et possibles grâce au developpement de nouveaux capteurs et systemes d’analyse des resultats...