P.27 Profils de méthylation de l’ADN dans les effluents biologiques du sujet atteint d’une tumeur colique ou rectale

Objectif Le cancer colo-rectal (CCR) est d’un cout tres eleve pour la societe. L’action de depistage est moins couteuse et permet de detecter precocement les tumeurs rectocoliques. Le test Hemoccult ® propose dans le depistage organise est peu performant. La recherche de nouveaux tests est utile et economique. La mise en evidence d’anomalies d’ADN est une alternative possible. Son cout actuel de test est tres eleve du fait du nombre de mutations a rechercher. Le but est de proposer un nombre restreint de genes cibles pour reduire le cout du test. Materiels et Methodes Les prelevements biologiques avant la coloscopie et les tissus (muqueuse normale, polype adenomateux, cancer invasif) ont ete soumis a une extraction d’ADN (Qiagen). Il s’agissait de selles provenant de sujets normaux (N = 10), avec cancer (N = 7) avec polype (N = 3), de tissus (normaux = 3, cancer = 3, et polype = 1), d’urines (normaux = 4, cancer = 7, polype = 6) et de serums (normaux = 4, cancer = 7, polype = 6). Des puces (illumina Goldengate IntegraGene) d’analyser de la methylation de 1 505 sites CpG correspondant aux 807 genes, ont ete utilisees. Les echantillons d’ADN ont ete traites par bisulfite de Na+ puis amplifies par deux sondes de florescence ciblant les formes methylee (M) et non methylee (U) des brins d’ADN. Le degre de methylation (beta) du gene etudie a ete etabli sur le rapport (beta = M)/(M+U) allant de 0 (non methyle) a 1 (totalement methyle) ponderee d’une valeur p technique (probabilite d’erreur sur le degre de methylation). L’analyse descriptive a ete realisee par un seuillage avec p vs polypes vs cancers) ont ete basee sur l’identification des meilleurs marqueurs differentiels pour le meme effluent biologique d’une part et sur la concordance de signaux entre differents effluents biologiques d’autre part. Resultats Le nombre de signaux fecaux a ete significativement plus faible que celui observes dans le tissu, le serum ou l’urine. Pour chaque effluent et sur la base de D = T (tumeur) - N (normal), les signaux ont ete traces. Ces derniers ont montre une heterogeneite importante inter-individuelle et intra-individuelle (d’un effluent a un autre). Les meilleures cibles hyper- et hypomethylees (10 % au sommet de l’iceberg) ont ete retenus, identifiees et un croisement de ces signaux sur toutes les combinaisons possibles d’effluents biologiques (2 a 2, 2 a 3 et 2 a 4) effectue. Un seul gene cible hypermethyle et trois hypomethyles ont ete identifies de facon concordante dans tous les effluents biologiques. Discussion Un panel de 4 genes est discriminant de la situation tumorale colorectale. S’il est reuni en un seul test, son cout sera tres faible. Conclusion Valide dans une population cible asymptomatique, il pourrait constituer une alternative au test Hemoccult ® actuellement preconise. Remerciements, financements, autres Soutenu par l’APHP, la SNFGE, CHIC, VSG et GE du Val de Marne.