细菌σ 54 启动子序列分析与预测

对实验确定的168条σ 54 启动子序列进行保守性分析, 获得两个保守的区域-24区域和-12区域, 均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数, 引入伪计数构建位置权重矩阵, 对168条σ 54 启动子进行预测, 分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验, 整体准确度达到82.0%, 为σ 54 启动子的理论和实验研究提供新信息。