Emergence de nouveaux pathotypes chez Ralstonia solanacearum : rôle des transferts horizontaux de gènes : [Résumé]

Ralstonia solanacearum est une bacterie phytopathogene responsable de la premiere bacteriose mondiale: le fletrissement bacterien. Cette  proteobacterie est capable d'infecter plus de 200 especes vegetales, principalement dans les regions tropicales. Grâce a sa plasticite genomique, R. solanacearum a ete decrite comme etant capable de contourner les resistances mises en place par les plantes, conduisant ainsi a l'emergence de nouveaux variants pathologiques. Nous nous donc sommes interesses au role fondamental des transferts de genes dans l'evolution de son genome. Au sein du complexe d'especes, la capacite de transformation naturelle a ete decrite comme un caractere ubiquiste. Ainsi, 80% des souches testees, appartenant aux 4 phylotypes, ont la capacite d'acquerir de l'ADN plasmidique et/ou genomique libre (Coupat et al., 2008, FEMS Microbiol Ecol 66:14-24). La taille et le nombre de ces evenements de transferts ont egalement ete evalues en utilisant des marqueurs selectifs de resistance aux antibiotiques mais egalement par hybridation comparative des genomes sur puces a ADN. Les resultats obtenus montrent que les remplacements peuvent impliquer des fragments d'ADN de plus de 90 kb et de multiples evenements peuvent intervenir au sein du genome de R. solanacearum. De plus, les etudes de transferts de genes interphylotypes ont montre que des transformants ont pu acquerir des blocs d'ADN de plus de 30 kb contenant des determinants pathogeniques issus de l'ADN donneur (Guidot et al., 2009, ISME J. doi:1038/ismej.2009.14). Ainsi, le mecanisme de transformation naturelle apparait comme une des forces majeures pouvant generer des pathogenes emergents. Nous avons pu verifier cette hypothese puisqu'un transformant obtenu in vitro, ayant acquis des effecteurs de type III non presents dans le genome de la souche sauvage, apparait comme plus agressif sur tomate. (Texte integral)