La chromoblastomycose et la sporotrichose à Madagascar : actualités épidémiologiques, cliniques et diagnostiques

La chromoblastomycose (CBM) et la sporotrichose (SPT) sont des infections fongiques chroniques des tissus sous-cutanes. Elles touchent surtout les membres, apres blessure vegetale ou souillure tellurique. Les principaux agents fongiques responsables de CBM appartiennent aux genres Fonsecaea et Cladophialophora tandis que Sporothrix est a l'origine de la SPT. A Madagascar, les etudes menees entre 1955 et 1994 ont montre une prevalence de la CMB a 0,5/100 000 habitants faisant considerer ce pays comme le premier foyer mondial. Depuis, aucune donnee n'a permis d'actualiser ces observations. Malgre les nombreux cas de SPT observes par les medecins, son epidemiologie a Madagascar n'a jamais ete decrite. L'objectif general etait d'evaluer l'incidence actuelle de ces mycoses a Madagascar. Les objectifs specifiques etaient de caracteriser les especes fongiques responsables et de mettre en place un reseau clinico-biologique perenne permettant une gestion adaptee des patients et l'utilisation de methodes moleculaires pour l'identification des souches. Une etude prospective conduite entre mars 2013 et juin 2017 a donne lieu a des consultations dans les regions ou dans le service de dermatologie de l'hopital universitaire d'Antananarivo et a permis d'inclure des patients presentant des lesions sous-cutanees chroniques. Les methodes conventionnelles de diagnostic mycologique ont ete completees par des methodes moleculaires (PCR, sequencage, MALDI-TOF-MS). Les cas ont ete classes au cours de reunions de concertation clinico-biologique. Au total, 148 patients d'âge moyen de 41 ans avec une predominance d'hommes (75,0%) ont ete inclus : 63 cas de SPT (42,5%) et 50 cas de CBM (33,8%) ont ete confirmes. L'incidence annuelle de le CBM a ete estimee a 0,38/100 000 habitants dans la region Sava au Nord ou les cas predominent avec au niveau du district Anosibe An'Ala (a l'Est) une incidence maximale de 1,12/100 000. Alors que la CBM etait predominante dans le Nord-Est, l'Est et le Sud de l'ile, etonnamment, la SPT etait presque exclusivement localisee sur les hautes terres centrales. L'incidence globale moyenne de SPT etait de 0,17/100 000 habitants dans les hauts plateaux et de 0,07/100 000 pour l'ensemble de Madagascar. Pour la SPT, le risque est plus eleve chez les jeunes (< 18 ans) et les formes cutaneo-lymphatiques des membres superieurs sont les plus frequentes. Pour la CBM, le risque de contamination est eleve chez les agriculteurs et les professions de services et la majorite des lesions (82,9%) etait localisee au niveau des membres inferieurs. Sur le plan mycologique, 63 Sporothrix schenckii, 7 Cladophialophora carrionii, 29 Fonsecaea sp dont 22 F. nubica ont ete identifies. Pour le genre Fonseceae, l'identification de l'espece nubica remplace l‘espece pedrosoi initialement proposee pour les isolats malgaches et souligne l'importance de l'identification moleculaire pour une classification precise des especes. Cette premiere etude sur la SPT humaine a Madagascar a permis d'actualiser les donnees epidemiologiques mondiales et de classer Madagascar avec un niveau endemique modere alors qu'il etait considere comme faible jusque-la. La CBM persiste a une incidence elevee et comparable a celle decrite jusqu'en 1994, illustrant l'absence de controle de cette mycose dans le pays. La constitution d'un reseau clinico-biologique local stable et les nouveaux outils diagnostics mis en place dans ce travail (PCR et le MALDI-TOF MS), vont faciliter la conduite de programmes de surveillance et de controle alors que l'OMS a recemment classe la CBM en maladie tropicale negligee. Une enquete environnementale est en cours pour detecter les sources de contamination dans l'environnement. Le reseau mis en place permettra dans un futur proche de nouvelles etudes therapeutiques (nouveaux schemas therapeutiques) ou genetique (facteurs d'hotes) sur la CBM et SPT mais egalement sur d'autres mycoses endemiques et encore negligees a Madagascar