Identification des dermatophytes par spectrométrie de masse MALDI-TOF

Introduction L’identification des dermatophytes par les methodes microbiologiques conventionnelles est souvent longue et fastidieuse. La technique de spectrometrie de masse et sa variante MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation-Time of Flight) est un nouvel outil utilise pour l’identification des bacteries et des levures dans les laboratoires d’analyses medicales. Nous avons recemment developpe une methode standardisee pour l’identification en routine des champignons filamenteux a partir de culture en milieu solide. L’objectif de cette etude est d’etendre cette methode standardisee a l’identification des dermatophytes dans l’activite de routine du laboratoire. Materiel et methode Une banque de reference contenant les spectres de masse de 44 souches parfaitement caracterisees correspondants a 13 especes de dermatophytes a ete generee sur un UltraFlex (BruckerDaltonics, Allemagne) couple au logiciel MaldiBiotyper v2.1. Par la suite, 133 souches isolees de prelevements cliniques ont ete identifiees en comparant leur spectre a ceux inclus dans la banque de reference : l’identification d’espece a ete retenue si le Log Score (LS) obtenu etait superieur ou egal a 1,7. Enfin, l’identification par MALDI-TOF a ete consideree comme correcte en cas de concordance avec l’identification morphologique ou moleculaire des isolats cliniques. Resultats L’identification par spectrometrie de masse(SM) a ete correcte pour 130 (97,8 %) des isolats. Pour 2 isolats identifies conventionnellement comme Microsporum canis, l’identification par SM n’a pas pu generer de spectre avec un LS valide. Pour un isolat correspondant a Microsporum audouinii, la SM a genere une mauvaise identification. Tous les isolats ont pu etre identifies apres seulement 3 a 6 jours de culture avant l’apparition des caracteres morphologiques conventionnels d’identification. Conclusion Le protocole de SM utilise pour l’identification des champignons filamenteux au laboratoire est applicable aux dermatophytes. Une identification d’espece peut etre obtenue en 3 a 6 jours alors qu’une identification conventionnelle qui necessite notamment des milieux de cultures complementaires demande 2 a 3 semaines.