Influence de la pression sur la dynamique du lysozyme en solution, par simulation numérique et diffusion de neutrons

Afin d'explorer l'effet d'une pression hydrostatique non denaturante (entre 1 bar et 3 kbar) sur les mouvements internes du lysozyme, deux approches sont conjuguees dans cette etude : des simulations de dynamique moleculaire et des experiences de diffusion quasielastique de neutrons, qui renseignent sur les correlations spatiales et temporelles des mouvements atomiques sur les memes echelles de temps (de 0. 1 ps a 10 ns) et de distance (de 0. 5 A a 20 A). Le systeme simule est constitue d'une molecule de lysozyme dans une boite de 3403 molecules d'eau, place dans l'ensemble isobare-isotherme. Les experiences de diffusion de neutrons sont pratiquees sur une solution de lysozyme a une concentration de 60 mg/ml. Les simulations montrent une diminution du volume du lysozyme ainsi qu'un raccourcissement des liaisons hydrogene avec l'augmentation de la pression. Les effets induits par la pression sur la dynamique interne du lysozyme simule sont de faible amplitude et se traduisent par une legere diminution de la partie quasielastique de la fonction de diffusion, diminution difficilement mise en evidence dans les resultats experimentaux. Par contre, il a ete possible de reproduire de facon satisfaisante le profil des spectres experimentaux a partir des simulations et d'utiliser le modele theorique dit fractionnaire pour rendre compte de la multiplicite des temps de relaxation qui caracterisent la dynamique interne du systeme complexe que constitue une proteine. Ce travail sur le lysozyme, proteine non adaptee a la pression, pourrait servir de reference pour des travaux similaires sur des proteines barophiles.