溶藻弧菌III 型分泌系统vscP 基因的克隆与生物信息学分析

根据NCBI 上登录的溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus）全基因组序列，设计一对克隆溶藻弧菌HY9901 株III 型分泌系统“分子尺”蛋白VscP 全长基因的特异性引物，PCR 扩增获得基因的全长片段。结果显示，vscP（GenBank 登录号FR780678）开放阅读框ORF 为1 206 bp，共编码401 个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子质量约为44.4 ku，等电点为5.72。Signal 4.1 Server 和TMHMM Server 2.0 预测结果表明，VscP 无信号肽与跨膜结构域。SoftBerry-Psite 预测结果显示，VscP 含有3 个N 端糖基化位点，2 个cAMP 及cGMP 依赖性蛋白激酶磷酸化位点，5 个蛋白激酶C 磷酸化位点，9 个酪蛋白激酶II 磷酸化位点，2 个N 端豆蔻酰基化位点，1个酰胺化位点和3 个微体C 末端靶信号位点。运用MEGA6.0 构建的VscP 系统进化树显示，溶藻弧菌VscP 与副溶血弧菌（V. parahaemolyticus）聚为一簇。应用SWISS-MODEL 软件构建VscP 亚基三维结构模型发现，其与鞭毛FilK 蛋白有相似构型。