Caractérisation génétique des races locales françaises de poules : Projet Biodiva

Les faibles effectifs observes chez les races traditionnelles, locales et/ou anciennes posent la question de leur conservation in- ou ex-situ. La caracterisation de leur diversite genetique est un des determinants essentiels de leur maintien et les analyses moleculaires s’averent etre l’outil ideal pour cela. 22 races locales de poules ont donc ete genotypees a raison de 60 individus par population en moyenne avec une puce a ADN haute densite (57K). 4 lignees commerciales temoin ont egalement ete integrees, soit un total de 26 populations et 1516 individus. La diversite intra-race est bonne, avec un niveau de consanguinite correct mais variable entre races (F moyen compris entre 3 et 28%), le niveau de consanguinite d’une race etant logiquement lie avec ses effectifs. Il existe egalement une grande diversite entre races (Fst=0.25), qui se differencient bien les unes des autres. De plus, les relations observees entre races sont coherentes avec leurs histoires. La structuration genetique s’explique ensuite principalement par la conduite des elevages. L’usage des races (pondeuses, de chair, commerciales) affecte aussi leur structure genetique. Finalement, ces analyses, combinees a la description morphologique des races, pourraient permettre de detecter des zones du genome d’interet pour la selection. En conclusion, les races locales francaises de poules presentent une grande diversite genetique, avec des specificites, permettant de les distinguer tres clairement les unes des autres. De plus leur gestion semble bien menee par les eleveurs et centres de selection avec le maintien d’une diversite intra et inter-population relativement importante.