Cartographie physique du genome de la microsporidie encephalitozoon cuniculi, arrangement des genes adnr et variabilite des regions subtelomeriques

La microsporidie encephalitozoon cuniculi, parasite intracellulaire amitochondrial possede avec 2,8 mpb l'un des plus petits genomes nucleaires. Ses 11 chromosomes de taille s'echelonnant de 210 a 302 kpb font l'objet d'un sequencage systematique en collaboration avec le cns-genoscope (evry). Dans ce cadre, une carte physique de ce genome a ete construite, grace a l'utilisation combinee de nouvelles techniques de marquage radioactif d'adn genomique et de 2-d pfge. Le kard-pfge (karyotype and restriction display) et le ddic-pfge (double digestion of isolated chromosomes), mis au point sur le genome de la levure saccharomyces cerevisiae, ont permis l'elaboration d'une carte de restriction des 69 sites bsshii et des 70 sites mlui du genome de l'isolat de reference d'e. Cuniculi provenant de souris (resolution moyenne inferieure a 20 kpb). De plus, 67 sts (sequenced tag sites) representant pres de 50 kpb ont ete attribues a des fragments de restriction bsshii et mlui. Ce genome presente la caracteristique de posseder a chacune des extremites chromosomiques une unite adnr. Cette propriete a ete mise en evidence pour les trois souches d'e. Cuniculi decrites a ce jour, chez plusieurs variants caryotypiques (type a, c, d et f). Deux isolats de la meme souche i et issus de lapins, mais differant par le caryotype (a et c) ont ete genomiquement compares par kard-pfge. Il est deduit que les regions subtelomeriques sont le lieu de rearrangements chromosomiques menant a des differences de taille entre chromosomes homologues d'un meme variant, et entre memes chromosomes des deux variants.