Prevotella and Porphyromonas spp. constituent le core microbiome spécifique des lésions à germes anaérobies de la maladie de Verneuil
2015
Introduction La maladie de Verneuil ou hidrosadenite suppuree (HS) est une maladie cutanee inflammatoire caracterisee par des lesions recidivantes ou chroniques des grands plis du corps. Nous avons montre qu’une vaste majorite de ces lesions est associee a une flore anaerobie polymorphe, a des streptocoques du groupe milleri et a des actinomycetes. Pour analyser de maniere exhaustive ces flores anaerobies, nous avons realise une etude prospective de metagenomique bacterienne. Materiel et methodes Soixante-cinq patients presentant divers stades de severite clinique de la maladie ont ete inclus dans cette etude. Cent quarante-quatre prelevements lesionnels et 173 prelevements en peau saine ont ete analyses par culture bacterienne. Les experiences de sequencage a haut debit ont ete realisees en utilisant la technologie Roche 454 apres creation de banques d’ADN ribosomal 16S par PCR. Resultats Cent seize sur 144 des prelevements lesionnels etaient associes a une flore anaerobie par culture bacterienne. La prevalence des streptocoques du groupe milleri et des actinomycetes au sein de ces flores etait de 34 % (39/116) et 33 % (38/116), contre 3 % et 5 % des prelevements en peau saine ( p −11 ), confirmant notre etude precedente. Par sequencage a haut debit, le core microbiome lesionnel anaerobie (i.e. : genres bacteriens associes a plus de 85 % des echantillons) etait compose de cocci a Gram positif anaerobies retrouves egalement dans les prelevements controles en peau saine ( Anaerococcus spp., Finegoldia spp., Peptoniphilus spp), et de deux genres de bacilles a Gram negatif anaerobies : Prevotella et Porphyromonas spp. Les lesions les plus severes presentaient une diversite bacterienne plus elevee et leur core microbiome specifique comportait un taxon supplementaire non retrouve en peau saine : Fusobacterium spp. Le sexe des patients, l’index de masse corporelle et la localisation des lesions n’avaient pas d’impact sur les microbiomes lesionnels. Discussion Prevotella et Porphyromonas spp. sont des bacilles a Gram negatif commensaux des muqueuses digestives et oropharyngees connus pour leur pathogenicite. La frequence de leur association aux lesions d’HS, independamment de leur localisation ou severite clinique, suggere qu’ils pourraient etre impliques dans la genese des lesions d’HS. Les taxons supplementaires associes aux lesions les plus severes, en particulier Fusobacterium spp, pourraient jouer un role dans la severite clinique de la maladie. Conclusion Cette etude prospective et comparative de metagenomique bacterienne a permis d’identifier un core microbiome anaerobie associe aux lesions d’HS : Prevotella et Porphyromonas spp. La pathogenicite de ces bacilles a Gram negatif anaerobies suggere qu’ils pourraient jouer un role dans la physiopathologie de l’HS.
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