Apports de la chémo-informatique dans la recherche et l’optimisation des molécules d’intérêt thérapeutique

Dans le processus de decouverte d’un medicament, l’identification de nouvelles entites chimiques (NCE) actives passe aujourd’hui par le criblage d’un nombre tres important de molecules disponibles dans des chimiotheques ou banques de produits publiques ou privees. En amont des techniques experimentales de criblage a haut debit (HTS), les approches de criblage virtuel et l’utilisation des outils de chemo- informatique ont pris une place importante dans le processus de selection des molecules a tester, l’objectif etant de focaliser, tres tot et a chaque etape cle d’un projet, sur les molecules les plus prometteuses. Le criblage virtuel est base sur des modeles « artificiels » soit de la cible visee, soit du ligand, ou encore sur des modeles de prediction du comportement biopharmaceutique des molecules (absorption, metabolisme, elimination, toxicite, etc.). De leur cote, les outils de chemo-informatique permettent une meilleure manipulation de l’ensemble de ces donnees, qu’elles soient virtuelles, comme par exemple dans l’analyse du potentiel de diversite chimique lors de la comparaison de collections de molecules, reelles ou virtuelles (molecules non encore synthetisees), ou qu’elles soient reelles dans le suivi de l’ensemble des donnees biologiques d’un projet. Les developpements recents permettent de condenser le grand nombre d’informations disponibles (virtuelles ou experimentales) en des representations simples facilitant l’exploitation. Ils sont applicables aussi bien au domaine de la chimie (chemographie) qu’a celui de la biologie (pharmacographie), et c’est l’exploitation combinee de l’information chimique et biologique, comme illustre dans ce travail, qui permettra un pilotage adapte et efficace des projets de recherche.