Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur (L.) i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch)

Biljke, kao sesilni organizmi koji ne mogu izbjeci stres, razvile su efikasne kratkorocne strategije za adaptaciju na promjene u okolisu koje se najvise odnose na brze promjene u ekspresiji gena putem epigenetickih mehanizama. U ovom diplomskom radu istraživane su epigeneticke promjene u dvije vrste, hrastu lužnjaku i bosanskom ljiljanu, i to u populacijama trajno izloženim abiotickom stresu uslijed promjena stanista. Upotrebom metode CRED-RA (Coupled Restriciton Enzyme Digestion-Random Amplification) analizirana je razina ukupne genomske metilacije DNA te metilacije specificnog rDNA genomskog podrucja. U genomu bosanskog ljiljana, između stresne i kontrolne populacije, utvrđena je znacajna razlika u ucestalosti polimorfizama nastalih zbog metilacijskih događaja. Zbog izrazito visoke intra-populacijske geneticke varijabilnosti hrasta lužnjaka, metoda CRED-RA se pokazala nedovoljno preciznom za utvrđivanje metilacijskih događaja na populacijskoj razini. Metodom RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), utvrđen je veci broj polimorfizama DNA u genomu populacija izloženih stresu obiju istraživanih vrsta. Analiza specificne metilacije rDNA genomskog podrucja otkrila je hipermetiliranost rDNA sustava hrasta lužnjaka. Usporedbom CRED-RA obrasca specificne metilacije i restrikcijske mape za 18S-26S rRNA podjedinicu ove vrste pronađena su 4 hipometilirana mjesta unutar intergenske razmaknice cija je funkcija regulacija transkripcije ovih gena.