Caracterización de la microbiota bacteriana ruminal de un bovino a pastoreo mediante técnicas clásicas e independientes del cultivo

La microbiota simbionte ruminal ha conferido a los rumiantes la ventaja evolutiva de poder aprovechar la fibra vegetal a traves de su metabolismo fermentativo. La fermentacion de la fibra en el rumen provee de fuentes de energia mientras que la biomasa microbiana aporta la principal fuente de proteinas. La comunidad bacteriana ruminal comprende varios cientos de especies bacterianas y esta distribuida en la fase solida del contenido ruminal, en el fluido ruminal y en una menor medida asociada al epitelio. Solo una fraccion de la microbiota ruminal, mayoritariamente anaerobia, puede ser cultivada y el advenimiento de los metodos moleculares ha permitido conocer la diversidad microbiana sin la necesidad de cultivo. Los objetivos de este trabajo fueron caracterizar la microbiota bacteriana ruminal cultivable y no cultivable asociada a las fracciones solida y liquida del contenido ruminal de un bovino a pastoreo y aislar y clasificar bacterias capaces de crecer en un medio de cultivo con celulosa como principal fuente de carbono y energia. Para evaluar la microbiota cultivable se utilizaron medios de cultivo artificiales mientras que el analisis de la comunidad microbiana total se realizo por medio de la tecnica de Fluorescent in situ hybridization (FISH). Se identificaron 16 aislamientos incluyendo miembros de los generos Butyrivibrio, Pseudobutyrivibrio, Succinivibrio y Selenomonas ademas de otros 4 que representan nuevas especies y generos bacterianos. Este trabajo representa una primera aproximacion en el pais dirigida a aislar e identificar microorganismos ruminales por medio de tecnicas bacteriologicas y moleculares.