基因芯片法快速检测脊柱结核临床分离株SM、EMB、LVFX、AMK、CPM耐药
2014
目的制备一种用于检测链霉素(streptomycin, SM)、乙胺丁醇(ethambutol, EMB)、左氧氟沙星(levofloxacin, LVFX)、阿米卡星(amikacin, AMK)、卷曲霉素(capreomycin, CMP)耐药基因的新型微阵列芯片,测试其快速检测脊柱结核临床分离株耐药的效果。方法 根据SM、EMB、LVFX、AMK、CPM 5种药物的常见耐药基因及突变位点(rpsL、rrs、embB、rrs及gyrA),制备DNA微阵列芯片,脊柱结核临床分离株耐药菌株111株及敏感菌株26株,均具备完整的临床信息及药敏结果,依次进行灭活、核酸提取、PCR扩增、芯片杂交、洗涤与扫描判读,与表型药敏结果对照,计算敏感度、特异度及95%CI。结果检测时间18~23(20.1±1.2)h。与表型药敏结果对照,基因芯片检测SM、EMB、LVFX、AMK、CPM耐药的敏感度分别为90.36%、61.90%、94.59%、66.00%、65.52%,其对应的特异度分别为70.37%、58.11%、58.00%、91.95%、80.56%;在26株全敏感菌株中,结果均显示为野生型,对5种抗结核药物耐药检测的特异度均为100%。结论 基因芯片法检测结核耐药耗时短,一线、二线耐药检测的敏感度、特异度令人满意,生物安全性高,能够满足临床耐多药结核快速诊断需要。
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