植物赤霉素氧化酶 GA20ox 基因的生物信息学分析

在植物发育和生理过程中， GA - 20 氧化酶 (GA - 20 oxidase, GA20ox) 起着非常重要的调控作用。运用生物信息学的方法，对 27 种不同植物的 GA20ox 基因的氨基酸序列的基本理化参数进行预测和分析，并构建其系统进化树。结果表明，植物 GA20ox 的蛋白质序列长度在 345~426 aa 之间，分子量在 39.23~49.15 kD 之间，等电点在 5.09~7.65 之间，大多数植物的 GA20ox 蛋白呈酸性、蛋白较为稳定、表现为亲水性、定位于细胞核中、具有多个功能位点 ( 包括磷酸化位点和糖基化位点 ) ； 27 种不同植物的含有 5 个保守基序，其中 Motif 1 和 Motif 2 为 2OG-FeII_Oxy 域， Motif 3 为 DIOX_N 域；基于氨基酸序列的系统聚类结果与物种间的亲缘关系远近相一致，具有明显种属特征； GA20ox 蛋白二级结构以无规则卷曲和 α - 螺旋为主要元件。该研究结果对深入解析植物 GA20 的生物学功能及 GA 调控机理具有重要意义，为以后植物定向改良育种实践提供理论参考。