Écologie des Escherichia coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) dans les effluents d'élevages bovins et le sol

Les Escherichia coli enterohemorragiques (EHEC) sont consideres comme l’un des plus importants groupes de pathogenes emergents responsables de toxi-infections alimentaires. Depuis ces dix dernieres annees, l’environnement est de plus en plus incrimine dans les epidemies a EHEC. Dans cette etude, nous nous sommes interesses a la prevalence des E. Coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) dans les exploitations laitieres ainsi qu’a leur survie dans les effluents d’elevages et le sol. Au sein des exploitations laitieres, une grande diversite de souches STEC, capables de persister sur de nombreux supports (abreuvoirs, murs et sol des enclos, etc), a ete observee. Dans les effluents d’elevages (fumier et lisier bovins non traites), la survie des STEC non-O157 a ete evaluee a plus de 90 jours. Lorsque les tas de fumier sont retournes (pratique d’assainissement menee par les exploitants) la survie est de seulement 45 jours ; la temperature elevee au cœur des andains (≥ 65°C) est associee au declin important des STEC. En ce qui concerne la survie dans les sols, nous avons montre qu’in vitro les souches STEC O26:H11 persistaient pendant plus d’une annee dans differents types de sols melanges a du fumier, meme en presence de taux d’humidite faibles (< 0,08 g H2O g-1 sol sec). La temperature ambiante (i. E. 20°C versus 4°C) est significativement associee (P<0,001) a une inhibition marquee des STEC. In situ, la survie et le transfert des STEC dans le sol a partir de bouses naturellement contaminees ont egalement ete evalues dans differentes stations d’un bassin versant d’altitude situe dans les Alpes du Nord. Les STEC sont capables de persister dans la matiere fecale et sont detectes dans le sol rhizospherique sous-jacent (jusqu’a 20 cm de profondeur) pendant environ 2 mois, jusqu’a la disparition complete des bouses. Dans la rhizosphere, la survie des STEC peut etre affectee par des populations microbiennes productrices de metabolites antibacteriens. En prenant comme modele de populations telluriques antagonistes, une souche de Pseudomonas productrice d’un antibiotique, le 2,4-diacetylphloroglucinol (Phl), aucun effet negatif de la production de cet antibiotique sur la survie d’E. Coli O157:H7 dans la rhizosphere du ble n’a pu etre cependant mis en evidence. L’ensemble de ces resultats suggere que l’environnement constituerait un reservoir important en STEC dont le controle passe notamment par le respect de mesures d’hygiene rigoureuses en exploitations