Apport de la biologie moléculairepour détecter les virus entériques humainsdans les coquillages

Les virus enteriques humains, par leurs proprietes physico-chimiques, sont capables de persister dans l’environnement et peuvent etre ensuite concentres par les coquillages, avec, pour consequence eventuelle, l’apparition d’epidemies de gastro-enterites ou d’hepatites. Le developpement de la biologie moleculaire a permis la mise au point de methodes fiables et sensibles pour detecter ces virus. Cependant, des etapes preliminaires de preparation de l’echantillon sont necessaires pour concentrer les particules virales mais aussi pour purifier les acides nucleiques extraits. Ces nouvelles methodes ont mis en evidence la presence de ces virus dans des echantillons preleves dans plusieurs pays et des similitudes sont observees concernant les frequences de detection et le caractere saisonnier de la contamination. L’epidemiologie moleculaire a clairement implique des virus dans des epidemies liees a la consommation de coquillage, en demontrant une identite de sequence entre la souche amplifiee a partir des prelevements de l’environnement et celle amplifiee dans les echantillons cliniques. Dans le futur, ces methodes seront importantes pour surveiller la qualite des aliments et pour comprendre l’historique et l’evolution de ces importants pathogenes.