Estudio del transcriptoma en "Capsicum chinense Jacq." resistente al virus huasteco vena amarilla del Chile

2008 
Para enriquecer el conocimiento del transcriptoma en la interaccion incompatible entre el PHYVV y plantas de chile habanero (Capsicum chinense Jacq.) de la colecta de INIFAP denominada BG-3821, se estudio el perfil de expresion de genes. Estos estudios son fundamentales para el conocimiento a nivel molecular de los mecanismos de senalizacion para el reconocimiento mutuo y en su caso la respuesta de defensa del hospedante al patogeno, lo que puede contribuir al diseno de nuevas estrategias de proteccion de los cultivos. Se uso un modelo de expresion diferencial en las plantas infectadas por el PHYVV y la metodologia de hibridacion sustractiva por supresion (SSH), para obtener una biblioteca de 99 fragmentos de genes (EST) cuya expresion fue inducida especificamente. La secuencia de los EST obtenidos mostro que los genes expresados en esta interaccion se pueden agrupar en las siguientes categorias: a) posibles genes de resistencia; b) genes involucrados en rutas de regulacion genetica; c) genes con funcion desconocida. Mediante el analisis tipo Northern se confirmo la expresion diferencial de un EST (clona R-100) seleccionado con base en su similitud de secuencia con genes con una funcion potencial en mecanismos de resistencia. Con nuestros resultados, se presentan las primeras evidencias de genes que posiblemente esten implicados en las rutas de reconocimiento y senalizacion en C. chinense en respuesta a PHYVV
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