四川地区鸡异刺线虫核糖体转录间隔区（ITS1/2）序列的遗传变异分析

探讨四川地区鸡异刺线虫（Heterakis gallinarum）的遗传变异情况,为该地区鸡异刺线虫病的流行特征及防控提供基础资料。采用PCR扩增四川7个地区共59个鸡源鸡异刺线虫核糖体ITS1-5.8S-ITS2片段并测序,所得序列剪切5.8S序列后,得到ITS1/2序列,并分析ITS1/2序列的遗传多样性;同时利用GenBank中已公布的异刺属（Heterakis）ITS1/2序列信息,进行系统发育研究。结果如下：59条鸡异刺线虫ITS1/2序列相似性较高（98.9%～100.0%）,ITS1序列间变异较ITS2大;59条序列有20个变异位点和14个单倍型（H1～H14）;四川种群具有丰富的单倍型多样性（Hd=0.532）和较低的核苷酸多样性（π=0.000 94）;种群间基因交流频繁（Nm=31.72）,群体遗传分化不明显（Fst=0.007 82）,以群体内变异为主（AMOVA分析值=99.22%）;从单倍型网络图及进化树（MP和ML）分析来看,7个地理种群未形成显著的地理种群结构,但四川整体种群曾经历过种群扩张（Tajima’s D=-2.553 31,Fu’s Fs=-10.564;P〈0.05）;进化树（MP和ML）能有效区分鸡异刺线虫与属内其他虫种。四川7个地区鸡的鸡异刺线虫基因交流频繁,遗传多样性较低。