青狗尾草(Setaria viridis) SBP 基因家族的鉴定及表达分析

SQUAMOSA 启动子结合蛋白家族作为一种转录调控因子广泛存在于植物中，起着调节生长发育及多种生理生化反应。目前，其编码基因已从多种植物中分离鉴定，但是在作为单子叶 C4 模式生物的青狗尾草中却尚未研究。本研究基于生物信息学方法，从青狗尾草全基因组中鉴定出 17 个 SBP 基因，对这些基因的结构、理化性质、染色体定位以及共线性进行分析，并且探讨了这些基因在不同组织的表达情况，此外，还对 SBP 蛋白质的基序和系统进化进行了分析。结果表明 17 个 SBP 基因分布于 9 条染色体上，其中  SvSBP1 与 SvSBP 9 、 SvSBP3 和 SvSBP12 、 SvSBP4 和 SvSBP14 具有线性同源性，共有 11 个基因包含 miR156  结合位点。这些基因编码的 SBP 蛋白表现出不同物种的某些 SBP 蛋白之间较同一物种的 SBP 蛋白的遗传关系更近，暗示这些 SBP 家族成员的基本特征早在单双子叶植物分化之前就已经形成。 SvSBP2 、 SvSBP8 、 SvSBP13 、 SvSBP17 在所有组织中都有表达， SvSBP15 、 SvSBP16 在所有组织中都不表达外，其余基因均在不同组织中特异性表达，其中花序分生组织中表达的基因数最多，暗示这些基因可能在青狗尾草花的形成中扮演重要角色，并与胁迫响应和叶片的生长发育相关。本研究为进一步鉴定基因功能、阐明青狗尾草生长发育的分子机理提供基础性信息。