DESENVOLVIMENTO DE UM MÉTODO MOLECULAR PARA A IDENTIFICAÇÃO DE VARIEDADES CLONAIS DE Coffea canephora POR MEIO DE PCR

O cafe Conilon, especie Coffea canephora , e uma planta perene, diploide (2n = 2× = 22), alogama, resultando em alta variabilidade genetica. Desta forma, a lavoura quando formada a partir de sementes pode resultar em plantas com caracteristicas muito discrepantes. Neste cenario, a producao de mudas e de grande valia para que a lavoura seja implantada de forma homogenea. Uma variedade clonal, com mudas provenientes de um trabalho previo de selecao de plantas matrizes, apresentam as seguintes vantagens em relacao a de sementes: menor custo de implementacao, maior produtividade, maior uniformidade de maturacao, melhor qualidade do grao, ciclo diferenciado de maturacao e programacao escalonada de colheita, proporcionando sucesso na formacao da lavoura. O Brasil e um importante produtor de cafe e o desenvolvimento de novas variedades faz-se necessario para manter e/ou aumentar sua eficiencia na producao. A legislacao brasileira regulamenta a comercializacao de novas sementes e mudas no mercado, e que envolve os conceitos de registro e protecao de cultivares. A Lei no 10.711, de 05 de agosto de 2003 e a Lei no 9.456, de 25 de abril de 1997 e suas regulamentacoes dispoem sobre o Sistema Nacional de Sementes e Mudas e institui o direito de protecao de cultivares respectivamente. O registro de uma cultivar, no Registro Nacional de Cultivares permite a producao, o beneficiamento e a comercializacao de sementes e mudas; Por outro lado, a protecao da cultivar no Servico Nacional de Protecao de Cultivares da o direito a propriedade intelectual ao seu obtentor. Este registro e/ou protecao sao baseados apenas em caracteristicas morfologicas, sendo que o melhorista responsavel pelo desenvolvimento da variedade assegura a descricao, fato este, que pode nao ser preciso no diagnostico precoce dos clones, visto que as caracteristicas morfologicas so podem ser analisadas apos o desenvolvimento da planta. Desta forma, o objetivo do presente trabalho visou desenvolver um metodo molecular que pode ser utilizado para a identificacao de variedades clonais de C. canephora , registradas e/ou protegidas no Brasil. Os clones componentes dessas variedades clonais, foram genotipados utilizando-se a plataforma Coffee Axiom chip – 26K  desenvolvido pela Embrapa, a partir do genoma de referencia, contendo cerca de 25 mil SNPs ( Single Nucleotide Polymorphism )Como resultado desta genotipagem foram obtidos 25.456 SNPs, destes 22.889 marcadores (89,88%) foram classificados com alta resolucao, dos quais 20.424 (80,23%) foram polimorficos para o conjunto de individuos das variedades analisadas. Os SNPs foram analisados e 8 deles foram selecionados para serem possiveis candidatos no uso da distincao alelica para a possivel identificacao dos clones de Conilon que compoem as variedades registradas e/ou protegidas no Ministerio da Agricultura, Pecuaria e Abastecimento (2017).