MADS-box 基因 GmAP3 的克隆及生物信息学分析

植物 MADS 盒基因蛋白是一类在生物发育过程中起着重要作用的转录因子家族。本研究在前期大豆花芽转录组测序分析的基础上，利用 RACE 技术成功克隆了一个 MADS-box 基因的全长 cDNA 序列，利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸基本性质和结构进行了系统分析。结果表明，该基因属于 MIKC 家族，为亲水性蛋白，稳定性较好；二级结构中同时含有α - 螺旋、 β - 转角、延伸链和无规则卷曲结构 , 其中 α -螺旋和无规则卷曲所占比例均较高；亚细胞定位分析显示其定位在细胞核上；聚类分析表明该基因属于 AP3 亚家族，该基因编码的氨基酸与拟南芥 AP3 蛋白的同源性为 41.18% ，与大豆中 GmNMH7 的同源性最高为 97% ，命名该基因为 GmAP3 。本研究成功克隆出 GmAP3 基因，为该基因的进一步研究提供实验材料，并通过生物信息学分析预测，为下一步该基因的功能研究提供依据。