História evolutiva do gênero Caiman Spix, 1825 (Crocodylia, Alligatoridae): delimitação de espécies através de uma abordagem integrativa.

O genero Caiman e composto pela maior diversidade de taxons dentre os crocodilianos Neotropicais, composto por tres especies: Caiman crocodilus (quatro subespecies), Caiman yacare e Caiman latirostris. Apesar disso, ha uma grande lacuna sobre a real diversidade de linhagens evolutivas e especies que existem dentro do genero, especialmente devido a falta de amostragem ao longo da distribuicao de todos os taxons. A utilizacao de metodos de descobrimento de especies usando modelos coalescente vem possibilitando a delimitacao de uma alta diversidade de especies cripticas, sendo fundamentais para estudos de taxonomia integrativa de complexos de especies morfologicamente conservados, como no caso de crocodilianos. O objetivo geral desta tese foi desvendar a historia evolutiva do genero Caiman, utilizando metodos coalescentes de descobrimento e validacao de especies utilizando marcadores mitocondriais e genomicos. Incorporados posteriormente em um arcabouco da taxonomia integrativa, possibilitando verificar o numero real de especies, as relacoes entre elas e como ocorreu essa diversificacao dentro do genero. No primeiro capitulo, utilizamos, pela primeira vez, uma amostragem representativa ao longo de toda a distribuicao do genero. A partir do uso do marcador mitocondrial Citocromo b e metodos de coalescentes de descobrimento de especies, foi possivel verificar uma alta diversidade de linhagens (10-13) no genero Caiman, alem de fazer uma filogenia datada para o genero e mostrar como os eventos geologicos durante o Oligoceno e Mioceno moldaram a diversificacao das grandes linhagens dentro de Caiman. Tambem discutimos os aspectos de ameacas e de estrategias para garantir a conservacao dessas linhagens. No segundo capitulo, realizamos uma sub-amostragem das linhagens mitocondriais encontradas no complexo Caiman crocodilus/yacare e C. latirostris e executamos um sequenciamento de nova geracao para incorporar dados multilocus (ddRADs) nas nossas analises de validacao de especies. Alem disso, utilizamos dados morfologicos como suturas craniais, contagens e padroes de escamas, e morfometria geometrica para verificar diferencas na forma do crânio entre as linhagens, por meio de uma abordagem integrativa. Os metodos de validacao de especies usando SNAPP e BPP foram similares aos resultados mitocondriais do capitulo um, e associados as diferencas encontradas na forma do crânio, suturas craniais e o padrao de escamas nos flancos, foi possivel verificar diferencas significativas que sugerem o reconhecimento de Caiman fuscus distribuido ao longo da bacia do Rio Magdalena e America Central, como especie, alem de comprovar o status taxonomico de Caiman yacare. No terceiro capitulo, utilizamos o mesmo banco de dados do capitulo um e incorporamos amostras das populacoes exoticas de Caiman crocodilus do sul da Florida para verificar o real status taxonomico da especie e determinar qual foi a possivel origem dessa populacao. Descobrimos que esta populacao introduzida e composta por apenas uma linhagem, Caiman crocodilus fuscus, com possivel origem na bacia do Rio Magdalena, na Colombia.